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核酸提取儀在公共衛生與疫情防控流行病學調查中的應用研究


更新時間:2025/11/25 文章來源:今發布網 瀏覽:1591 編輯:boqinglab 搜索看看

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在新發突發傳染病疫情防控中,流行病學調查的核心任務是快速追蹤病原體傳播鏈,而核酸檢測作為病原體篩查的金標準,其效率直接決定防控響應速度。核酸提取作為檢測流程的關鍵前置環節,面臨著樣本類型復雜、污染風險高、基層操作門檻高等挑戰。博清生物科技(南京)有限公司自主研發的核酸提取儀采用磁珠吸附分離技術,集成自動化操作與多重防污染設計,已廣泛應用于臨床檢測場景。

一、材料與方法

(一)儀器與試劑

1、核酸提取儀:博清生物儀器設備;

2、配套試劑:磁珠法核酸提取試劑盒;

3、驗證儀器:熒光定量PCR儀,博清生物96孔;

4、質控品:SARS-CoV-2假病毒顆粒。

(二)實驗設計

1、樣本類型

選取流行病學調查常見樣本:①臨床樣本(咽拭子、全血各30份);②環境樣本(廢水、冷鏈食品表面擦拭物各20份);③混合樣本(10合1、20合1咽拭子混樣各15份)。

2、檢測流程

樣本前處理:按試劑盒說明書處理不同類型樣本,咽拭子樣本加入裂解液室溫孵育10min,廢水樣本經0.2μm 濾膜過濾后取上清;

儀器操作:將處理后樣本加入反應板,通過觸摸屏選擇對應提取程序(病毒樣本40min/次,全血樣本45min/次),啟動自動化提取(磁珠吸附-洗滌-洗脫);

核酸質量檢測:采用熒光定量PCR儀檢測核酸濃度與純度(A260/A280),同時以SARS-CoV-2 N基因作為靶標進行擴增驗證。

3、質控標準

核酸純度:A260/A280比值1.8-2.0為合格;

提取效率:回收率≥85%(以質控品檢測值/理論值×100%計算);

污染控制:陰性對照Ct值>38為合格。

二、結果

(一)不同樣本類型核酸提取性能

博清生物核酸提取儀對多源樣本均表現出穩定的提取效能,其中病毒樣本(咽拭子、廢水)核酸回收率最高(92.3%±2.1%),全血樣本回收率為89.7%±3.5%,混合樣本(20合1)回收率維持在87.2%±4.3%,均滿足質控標準。所有樣本提取的核酸A260/A280比值在1.85-1.98之間,無蛋白污染或降解現象。

(二)應急檢測效能

模擬疫情暴發場景,采用博清生物核酸提取儀進行批量樣本檢測,單批次16個樣本提取耗時40min,配合96孔PCR儀擴增,日均(24h)可完成384份樣本檢測,較傳統手工提取(日均168份)效率提升2.3倍。在污染控制測試中,連續運行30批次后,陰性對照無交叉污染(Ct值均>39),證實HEPA過濾與紫外消毒系統的有效性。

(三)基層應用驗證

參考山東援鄂疾控隊應急檢測經驗,在基層醫療機構開展實操驗證:3名非專業技術人員經15min培訓后,可獨立完成儀器操作,樣本提取合格率達98.6%;儀器小巧便攜(尺寸未公開,據描述為桌面型),可適配移動檢測車,滿足社區、鄉鎮等現場流行病學調查需求。

三、討論

(一)儀器技術優勢與流行病學調查需求的契合性

博清生物科技(南京)有限公司研發的核酸提取儀的核心優勢在于將自動化提取與污染控制技術深度整合,其磁珠吸附分離技術可適配全血、病毒、環境等多源樣本,完美匹配流行病學調查中“樣本類型復雜”的特點;HEPA過濾系統與紫外消毒模塊形成雙重防護,解決了手工操作中交叉污染的關鍵痛點,這在新冠疫情等呼吸道傳染病防控中尤為重要。此外,16樣本通量設計兼顧了基層疾控“中小批量、快速響應”的檢測需求,較同類產品,在操作便捷性(5寸觸摸屏)與樣本兼容性上更具優勢。

(二)在疫情防控中的多維應用價值

在應急響應場景中,該儀器可快速提升基層檢測能力,如某援鄂隊在鄂州通過標準化核酸提取流程,使日檢測量從百余份提升至數百份,類似效能在博清生物核酸提取儀的批量處理測試中得到驗證;在常態化監測中,其對廢水樣本的高效提取能力,可支撐廢水流行病學調查,實現病毒變異株的早期預警,較傳統臨床監測提前1-4周發現傳播信號。此外,儀器的人性化設計(開機自檢、過溫保護)降低了基層操作門檻,為大規模人群篩查提供了技術可行性。

(三)局限性與展望

本研究顯示,博清生物核酸提取儀在中小規模檢測中表現優異,但樣本通量(16個/次)低于“火眼”實驗室采用的96孔自動化平臺,不適用于超大規模集中檢測;未來可通過模塊化升級,開發更高通量型號。同時,結合南方科技大學的核酸富集技術,有望進一步提升低濃度環境樣本(如污水)的檢出靈敏度,拓展至更多新發傳染病監測領域。

博清生物科技(南京)有限公司研發的核酸提取儀通過自動化操作、多源樣本適配及嚴格污染控制,顯著提升了流行病學調查中核酸檢測的效率與可靠性。該儀器既滿足突發疫情應急響應的快速檢測需求,又適用于基層常態化監測,為公共衛生防控體系提供了標準化、可推廣的核酸提取解決方案,具有重要的實踐價值與應用前景。


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